何かを作りながらPythonの基礎を学ぼうかと思います。
仕事で使えそうなもののほうがモチベーションが上がるので、
今回はPCRで使うプライマーのTm値計算機を作ってみます。
また、細かく書いていきたいのでシリーズになります。
構想
プライマーのTm値の計算法を理解する
-
Wallace法
-
最近接塩基対法
Pythonを使って次のようなことができるようにする
-
プライマーの配列を入れるとTm値を返す
-
相補鎖配列を返す
-
GC%を返す
-
エクセルに配列を入れるとバッチ処理してくれる
学ぶこと
Tm値計算機作成にあたってpythonの以下のような方法を使います。
-
Pythonでの文字列の取扱い
-
Pythonでの計算
-
関数の作成
-
Pandas による表計算・DataTableの取扱い
-
openpyxlによるExcelの読み書き
では、次回から作っていきましょう！！
ちなみに、PythonではないですがJavascriptでTm値の計算機を作りました。
こちらもご利用ください。