Research Tool
プライマーTm値計算機
Length 0 base
GC% 0.0 %
Wallace法 0.0 ℃
最近接塩基対法 - ℃
ATCG以外の文字が含まれています。
PCRを実施する際のアニーリング温度の参考に、
プライマーのTm値の計算機を作りました。
鋭意改良していきますので、こうしてほしいとかがあればコメントください。
プライマーTm値計算機
Wallace法の計算式
Tm = 2 x (AとTの数の総和) + 4 x (GとCの数の総和)
最近接塩基対法の計算式
Tm = (1000 x ΔH) /( -10.8 + ΔS + 1.987 x ln(Conc/4)) - 273.15 + 16.6log[Na+]
参考過去記事
具体的な計算方法は過去記事にしておりますので、ご参考にどうぞ
↓PythonでGC%や相補鎖配列を取得する方法はこちら↓
関連記事PCRプライマーのTm値の計算機を作ってみよう①~相補鎖配列とGC含量の計算~ →
↓Wallace法や最近接塩基対法の詳しい計算方法はこちら↓
関連記事PCRプライマーのTm値の計算機を作ってみよう②~Tm値の計算法~ →
↓Pythonで自分でTm値計算を実装したいひとはこちら↓