Bioinformatics Notebook
Decode biology
with Data.
with Data.
バイオインフォマティクス・機械学習・AI・ネットワーク解析を軸に、生命のコードを解き明かすための知識と手法を発信。
Network Analysis
WGCNA解析
Network
WGCNA解析 part 1
DEG解析から一歩進んだWGCNA解析の流れを解説。モジュール作成から着目モジュールの選定まで。
2025.11.02
Network
WGCNA解析 part 2
着目モジュールを深堀り。GSVA scoreとの関係から生物学的意義を読み解く。
2025.11.22
ベイジアンネットワーク解析(CBNplot)
RNA-seq
bulk RNA-seq (HISAT2-StringTie-Ballgown)
RNA-seq
① ターミナルでコマンドラインを使う
2025.09.14
RNA-seq
② 環境設定
2025.09.14
RNA-seq
③ 公共データベースからダウンロード
2025.09.15
RNA-seq
④ HISAT2でマッピングする
2025.09.15
RNA-seq
⑤ StringTieの使い方
2025.09.15
RNA-seq
⑥ Ballgownで発現差解析
2025.09.15
Google Colaboratory