2026/06/28
WGCNA blockwiseModules の主要パラメータ：deepSplit・minModuleSize・mergeCutHeight の意味と決め方
WGCNAのblockwiseModulesでモジュール数やサイズがうまく決まらない時のために、power・deepSplit・minModuleSize・mergeCutHeight・maxBlockSize の意味と決め方を、ケース別の早見表つきで解説します。
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#wgcna
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2026/06/02
WGCNA を R で実装：GEOデータ取得〜モジュール検出〜ハブ遺伝子まで全Rコード付き（前半無料） 🔒 一部有料
GEOデータ取得、edgeR/voom正規化、softPower・blockwiseModulesでのモジュール検出、kME/kWithin/GSでのハブ遺伝子ランキングまで、WGCNAをRで最初から実装する手順を全Rコード付きで解説。前半無料。
2025/11/22
WGCNA解析 part 2：疾患関連モジュールの機能を読み解き、ターゲット候補遺伝子を絞り込む
WGCNAで抽出したModule 3をGSVA、エンリッチメント解析、kMEやkWithinによる遺伝子優先順位付けで深掘りします。
2025/11/02
WGCNA解析 part 1：RNA-seqデータを使って、疾患に絡む遺伝子ネットワークを可視化する
RNA-seq発現データを用いたWGCNA解析の流れを、softPower選択、モジュール検出、形質相関まで解説します。