PythonでIBDの疾患モジュールを解析する：既存薬からリポジショニング候補を絞り込むまで（前半無料） 🔒 一部有料
IBD承認薬10剤はすべて疾患モジュールに有意に近い。しかしその近さの正体は「標的がIBD遺伝子そのもの」だった。Open Targetsのシード取得からSTRING物理PPI構築、次数一致ランダム化、薬剤近接性のz-score、標的＝シードを外した再スクリーニングまでをPythonの全コードで解説します。実行結果の期待値と図の生成コード付き。前半無料。
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#network-medicine
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更新 2026/08/11
Disease Module入門 #2：シード・ネットワーク・検出法と統計的検証
疾患モジュールを実際に作る手順を解説します。シード遺伝子の設計、ネットワークの選び方、DIAMOnD・拡散・Steiner treeなど5つの検出法の使い分け、そして次数を保ったランダム化による統計的検証まで、つまずきやすい点を押さえます。
更新 2026/08/11
Disease Module入門 #1：疾患をネットワークの局所的な破綻として読む
複雑疾患を「点」ではなく分子ネットワークの「領域」として捉える疾患モジュールの考え方を、トポロジカル／機能／疾患モジュールの違い、数理的定義、疾患間関係まで、ネットワーク医学の基礎から解説します。