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IBD承認薬10剤はすべて疾患モジュールに有意に近い。しかしその近さの正体は「標的がIBD遺伝子そのもの」だった。Open Targetsのシード取得からSTRING物理PPI構築、次数一致ランダム化、薬剤近接性のz-score、標的＝シードを外した再スクリーニングまでをPythonの全コードで解説します。実行結果の期待値と図の生成コード付き。前半無料。

GWASシグナルから因果遺伝子を特定するL2Gスコアの仕組みを解説し、L2G × Tractability × 臨床フェーズの3条件で「まだ誰も着手していない有望ターゲット」を発掘するワークフローをアルツハイマー病と9疾患のデータで示します。

Open Targets PlatformのGraphQL APIをPythonで叩いて、アルツハイマー病の関連ターゲット一覧をDataFrameに変換する方法を解説。ページネーション実装からdatatypeスコアの読み方、大量取得時のParquet活用まで。

Open Targets PlatformのWeb UIを使い、アルツハイマー病を例に疾患から創薬ターゲット候補を探す実践手順を解説。スコアの読み方からTarget Prioritisationビュー、Evidenceページまで網羅します。

Open Targets Platformの概要と使いどころを解説。創薬ターゲット探索に必要なエビデンス統合の仕組み、データソース階層、L2Gスコアの読み方を網羅します。